网站优化和搜索引擎优化的区别主要表现在于：网站优化除了考虑搜索引擎因素外，偏重于网站的整体结构和质量及网站的用户体验方面。而搜索引擎优化考虑的重点偏重于搜索引擎友好性方面的要素，但也并非是做搜索引擎的作弊。
网站优化与搜索引擎排名(seo)优化的本质区别在于：网站优化是用网络营销导向的网站建设思想来指导网站基本要素的专业化设计，是一项系统性和全局性的工作，从而让网站更好的实现向用户传递网络营销信息的目的；根本上说，网站优化既是对用户的优化，也是对搜索引擎的优化，都较偏重于网站的内部因素。